En 1976, ce cours d'eau donna son nom au virus Ebola qui fut identifié lors d'une épidémie dans la ville de Yambuku (Nord-Est de la province d'Équateur) près de laquelle passe la rivière
La maladie à virus Ebola est apparue pour la première fois en 1976, lors de deux flambées simultanées à Nzara (Soudan) et à Yambuku (République démocratique du Congo). Yambuku étant situé près de la rivière Ebola, celle-ci a donné son nom à la maladie.