Un protocole est un document conçu pour guider la prise de décision autour de problèmes spécifiques : diagnostiquer, traiter, soigner une personne présentant une maladie précise, enrayer la propagation d'une infection ou notifier qu'un événement a eu lieu.
Le protocole définit, étape par étape, les actions à entreprendre, en expliquant la raison et la justification de chaque action.
Comme un "guide" destiné au personnel de santé, pour l'aider à prendre les mesures qui s'imposent et obtenir les meilleurs résultats.